Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Barhl1P63157 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Barhl1P63157 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Barhl1P63157 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Barhl1P63157 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Barhl1P63157 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Barhl1P63157 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Barhl1P63157 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Barhl1P63157 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Barhl1P63157 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Barhl1P63157 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Barhl1P63157 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Barhl1P63157 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Barhl1P63157 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Barhl1P63157 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Barhl1P63157 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Barhl1P63157 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Barhl1P63157 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Barhl1P63157 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Barhl1P63157 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms