Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uba52P62984 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Uba52P62984 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Uba52P62984 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uba52P62984 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uba52P62984 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uba52P62984 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uba52P62984 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms