Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf3P61205 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf3P61205 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf3P61205 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf3P61205 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf3P61205 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arf3P61205 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arf3P61205 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arf3P61205 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf3P61205 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arf3P61205 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms