Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2d1P61080 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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