Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sem1P60897 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sem1P60897 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sem1P60897 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sem1P60897 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sem1P60897 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sem1P60897 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sem1P60897 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sem1P60897 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sem1P60897 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sem1P60897 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sem1P60897 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sem1P60897 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sem1P60897 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sem1P60897 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sem1P60897 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sem1P60897 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sem1P60897 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sem1P60897 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sem1P60897 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sem1P60897 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sem1P60897 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms