Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ActbP60710 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ActbP60710 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ActbP60710 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ActbP60710 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ActbP60710 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ActbP60710 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ActbP60710 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ActbP60710 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ActbP60710 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ActbP60710 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ActbP60710 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ActbP60710 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ActbP60710 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ActbP60710 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ActbP60710 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ActbP60710 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ActbP60710 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ActbP60710 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ActbP60710 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ActbP60710 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ActbP60710 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ActbP60710 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ActbP60710 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ActbP60710 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ActbP60710 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ActbP60710 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ActbP60710 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ActbP60710 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ActbP60710 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ActbP60710 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ActbP60710 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ActbP60710 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ActbP60710 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ActbP60710 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ActbP60710 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ActbP60710 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ActbP60710 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ActbP60710 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ActbP60710 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ActbP60710 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ActbP60710 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ActbP60710 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ActbP60710 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ActbP60710 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ActbP60710 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ActbP60710 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ActbP60710 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ActbP60710 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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ActbP60710 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ActbP60710 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ActbP60710 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ActbP60710 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ActbP60710 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ActbP60710 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ActbP60710 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ActbP60710 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ActbP60710 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ActbP60710 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ActbP60710 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ActbP60710 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ActbP60710 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ActbP60710 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ActbP60710 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ActbP60710 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ActbP60710 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ActbP60710 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ActbP60710 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ActbP60710 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ActbP60710 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ActbP60710 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ActbP60710 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ActbP60710 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ActbP60710 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ActbP60710 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ActbP60710 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ActbP60710 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ActbP60710 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ActbP60710 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms