Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gp1bbP56400 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms