Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms