Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efnb1P52795 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms