Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LumP51885 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LumP51885 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LumP51885 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LumP51885 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LumP51885 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LumP51885 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LumP51885 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LumP51885 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LumP51885 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LumP51885 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LumP51885 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LumP51885 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LumP51885 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LumP51885 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LumP51885 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LumP51885 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LumP51885 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LumP51885 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LumP51885 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LumP51885 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LumP51885 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LumP51885 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LumP51885 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LumP51885 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LumP51885 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LumP51885 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LumP51885 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LumP51885 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LumP51885 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LumP51885 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LumP51885 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LumP51885 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LumP51885 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LumP51885 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LumP51885 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LumP51885 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LumP51885 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LumP51885 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LumP51885 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LumP51885 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LumP51885 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LumP51885 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LumP51885 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LumP51885 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LumP51885 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LumP51885 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LumP51885 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LumP51885 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LumP51885 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LumP51885 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LumP51885 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LumP51885 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LumP51885 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LumP51885 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LumP51885 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LumP51885 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LumP51885 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LumP51885 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LumP51885 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LumP51885 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LumP51885 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LumP51885 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LumP51885 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LumP51885 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LumP51885 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LumP51885 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LumP51885 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LumP51885 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LumP51885 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LumP51885 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LumP51885 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LumP51885 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LumP51885 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LumP51885 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LumP51885 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LumP51885 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LumP51885 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LumP51885 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LumP51885 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LumP51885 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LumP51885 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LumP51885 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LumP51885 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LumP51885 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LumP51885 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LumP51885 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LumP51885 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LumP51885 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LumP51885 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LumP51885 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LumP51885 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LumP51885 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LumP51885 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LumP51885 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LumP51885 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LumP51885 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LumP51885 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LumP51885 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LumP51885 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms