Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp3P49194 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms