Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rplp1P47955 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rplp1P47955 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rplp1P47955 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rplp1P47955 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rplp1P47955 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rplp1P47955 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms