Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrprbP47758 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrprbP47758 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrprbP47758 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrprbP47758 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SrprbP47758 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrprbP47758 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SrprbP47758 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrprbP47758 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrprbP47758 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrprbP47758 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrprbP47758 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms