Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkx1-2P42580 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nkx1-2P42580 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx1-2P42580 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms