Protein–RNA interactions for Protein: P35979

Rpl12, 60S ribosomal protein L12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl12P35979 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rpl12P35979 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl12P35979 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms