Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin1P35438 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin1P35438 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin1P35438 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin1P35438 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin1P35438 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin1P35438 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin1P35438 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin1P35438 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin1P35438 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin1P35438 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms