Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RxraP28700 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RxraP28700 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RxraP28700 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RxraP28700 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RxraP28700 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RxraP28700 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RxraP28700 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RxraP28700 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RxraP28700 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RxraP28700 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RxraP28700 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RxraP28700 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RxraP28700 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RxraP28700 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RxraP28700 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RxraP28700 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RxraP28700 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RxraP28700 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RxraP28700 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RxraP28700 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RxraP28700 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RxraP28700 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RxraP28700 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RxraP28700 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RxraP28700 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RxraP28700 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RxraP28700 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RxraP28700 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RxraP28700 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RxraP28700 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RxraP28700 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RxraP28700 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RxraP28700 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RxraP28700 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RxraP28700 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RxraP28700 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RxraP28700 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RxraP28700 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RxraP28700 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RxraP28700 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RxraP28700 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RxraP28700 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RxraP28700 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RxraP28700 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RxraP28700 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RxraP28700 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RxraP28700 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RxraP28700 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RxraP28700 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RxraP28700 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RxraP28700 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RxraP28700 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RxraP28700 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RxraP28700 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RxraP28700 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RxraP28700 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RxraP28700 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RxraP28700 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RxraP28700 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RxraP28700 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RxraP28700 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RxraP28700 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RxraP28700 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RxraP28700 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RxraP28700 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RxraP28700 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RxraP28700 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RxraP28700 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RxraP28700 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RxraP28700 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RxraP28700 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RxraP28700 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RxraP28700 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RxraP28700 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RxraP28700 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RxraP28700 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RxraP28700 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RxraP28700 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RxraP28700 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RxraP28700 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RxraP28700 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RxraP28700 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RxraP28700 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RxraP28700 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RxraP28700 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RxraP28700 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RxraP28700 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RxraP28700 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RxraP28700 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RxraP28700 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RxraP28700 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RxraP28700 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RxraP28700 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RxraP28700 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RxraP28700 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RxraP28700 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RxraP28700 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RxraP28700 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RxraP28700 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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