Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Marcksl1P28667 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Marcksl1P28667 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms