Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PparaP23204 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PparaP23204 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PparaP23204 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PparaP23204 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PparaP23204 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PparaP23204 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PparaP23204 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PparaP23204 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PparaP23204 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PparaP23204 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PparaP23204 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PparaP23204 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PparaP23204 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PparaP23204 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PparaP23204 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PparaP23204 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PparaP23204 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PparaP23204 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PparaP23204 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PparaP23204 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PparaP23204 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PparaP23204 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PparaP23204 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PparaP23204 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PparaP23204 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PparaP23204 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PparaP23204 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PparaP23204 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PparaP23204 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PparaP23204 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PparaP23204 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PparaP23204 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PparaP23204 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PparaP23204 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PparaP23204 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PparaP23204 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PparaP23204 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PparaP23204 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PparaP23204 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PparaP23204 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PparaP23204 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PparaP23204 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PparaP23204 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PparaP23204 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PparaP23204 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PparaP23204 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PparaP23204 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PparaP23204 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PparaP23204 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PparaP23204 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PparaP23204 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PparaP23204 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PparaP23204 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PparaP23204 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PparaP23204 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PparaP23204 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PparaP23204 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PparaP23204 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PparaP23204 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PparaP23204 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PparaP23204 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PparaP23204 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PparaP23204 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PparaP23204 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PparaP23204 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PparaP23204 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PparaP23204 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PparaP23204 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PparaP23204 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PparaP23204 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PparaP23204 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PparaP23204 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PparaP23204 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PparaP23204 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PparaP23204 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PparaP23204 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PparaP23204 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PparaP23204 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PparaP23204 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PparaP23204 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PparaP23204 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PparaP23204 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PparaP23204 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PparaP23204 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PparaP23204 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PparaP23204 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PparaP23204 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PparaP23204 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PparaP23204 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PparaP23204 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PparaP23204 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PparaP23204 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PparaP23204 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PparaP23204 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PparaP23204 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PparaP23204 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PparaP23204 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PparaP23204 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PparaP23204 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms