Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RarbP22605 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RarbP22605 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RarbP22605 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RarbP22605 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RarbP22605 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RarbP22605 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RarbP22605 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RarbP22605 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RarbP22605 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RarbP22605 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RarbP22605 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RarbP22605 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RarbP22605 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RarbP22605 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RarbP22605 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RarbP22605 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RarbP22605 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RarbP22605 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RarbP22605 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RarbP22605 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RarbP22605 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RarbP22605 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RarbP22605 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RarbP22605 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RarbP22605 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RarbP22605 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RarbP22605 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RarbP22605 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RarbP22605 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RarbP22605 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RarbP22605 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RarbP22605 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RarbP22605 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RarbP22605 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RarbP22605 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RarbP22605 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RarbP22605 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RarbP22605 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RarbP22605 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RarbP22605 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RarbP22605 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RarbP22605 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RarbP22605 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RarbP22605 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RarbP22605 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RarbP22605 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RarbP22605 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RarbP22605 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RarbP22605 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RarbP22605 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RarbP22605 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RarbP22605 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RarbP22605 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RarbP22605 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RarbP22605 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RarbP22605 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RarbP22605 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RarbP22605 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RarbP22605 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RarbP22605 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RarbP22605 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RarbP22605 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RarbP22605 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RarbP22605 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RarbP22605 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RarbP22605 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RarbP22605 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RarbP22605 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RarbP22605 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RarbP22605 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RarbP22605 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RarbP22605 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RarbP22605 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RarbP22605 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RarbP22605 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RarbP22605 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RarbP22605 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RarbP22605 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RarbP22605 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms