Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou3f1P21952 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou3f1P21952 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou3f1P21952 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou3f1P21952 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou3f1P21952 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou3f1P21952 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou3f1P21952 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou3f1P21952 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou3f1P21952 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou3f1P21952 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou3f1P21952 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou3f1P21952 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou3f1P21952 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou3f1P21952 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms