Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prim1P20664 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Prim1P20664 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prim1P20664 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prim1P20664 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prim1P20664 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prim1P20664 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prim1P20664 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prim1P20664 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prim1P20664 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prim1P20664 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prim1P20664 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prim1P20664 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms