Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkcaP20444 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms