Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefhP19246 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefhP19246 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefhP19246 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefhP19246 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefhP19246 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefhP19246 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefhP19246 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefhP19246 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefhP19246 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefhP19246 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefhP19246 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefhP19246 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NefhP19246 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NefhP19246 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NefhP19246 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefhP19246 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefhP19246 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefhP19246 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NefhP19246 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefhP19246 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefhP19246 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefhP19246 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefhP19246 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NefhP19246 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefhP19246 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NefhP19246 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefhP19246 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefhP19246 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefhP19246 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefhP19246 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NefhP19246 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefhP19246 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefhP19246 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NefhP19246 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefhP19246 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NefhP19246 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefhP19246 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefhP19246 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefhP19246 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefhP19246 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefhP19246 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefhP19246 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NefhP19246 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefhP19246 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefhP19246 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefhP19246 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefhP19246 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefhP19246 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefhP19246 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefhP19246 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefhP19246 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefhP19246 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefhP19246 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NefhP19246 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NefhP19246 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NefhP19246 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NefhP19246 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NefhP19246 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NefhP19246 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NefhP19246 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NefhP19246 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NefhP19246 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NefhP19246 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NefhP19246 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NefhP19246 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NefhP19246 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NefhP19246 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NefhP19246 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NefhP19246 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NefhP19246 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NefhP19246 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NefhP19246 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NefhP19246 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NefhP19246 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NefhP19246 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NefhP19246 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NefhP19246 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NefhP19246 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NefhP19246 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NefhP19246 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NefhP19246 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NefhP19246 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NefhP19246 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NefhP19246 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NefhP19246 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NefhP19246 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NefhP19246 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NefhP19246 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NefhP19246 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NefhP19246 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NefhP19246 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NefhP19246 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NefhP19246 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NefhP19246 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NefhP19246 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NefhP19246 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NefhP19246 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NefhP19246 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NefhP19246 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms