Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnc1P19123 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnc1P19123 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms