Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Schip1P0DPB4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Schip1P0DPB4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms