Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CatspereP0DP43 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatspereP0DP43 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms