Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2aP08775 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2aP08775 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms