Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgamP05555 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgamP05555 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgamP05555 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgamP05555 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgamP05555 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgamP05555 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgamP05555 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgamP05555 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgamP05555 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgamP05555 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgamP05555 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgamP05555 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgamP05555 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgamP05555 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms