Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt1P04104 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt1P04104 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt1P04104 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt1P04104 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt1P04104 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt1P04104 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms