Protein–RNA interactions for Protein: P01676

Ig kappa chain V-VI region XRPC 24, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01676 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01676 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01676 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01676 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01676 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01676 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01676 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01676 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01676 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01676 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01676 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01676 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01676 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01676 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01676 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01676 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01676 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01676 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01676 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01676 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01676 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01676 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01676 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01676 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01676 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01676 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01676 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01676 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01676 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01676 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01676 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01676 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01676 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01676 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01676 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P01676 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01676 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01676 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P01676 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01676 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01676 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01676 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01676 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01676 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01676 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01676 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P01676 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01676 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01676 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01676 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01676 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01676 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01676 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01676 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01676 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01676 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01676 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01676 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01676 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01676 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01676 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01676 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01676 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01676 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01676 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01676 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01676 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01676 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01676 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01676 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01676 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01676 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01676 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01676 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01676 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01676 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01676 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01676 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01676 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01676 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01676 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01676 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01676 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01676 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01676 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01676 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01676 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01676 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01676 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01676 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01676 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01676 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P01676 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P01676 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01676 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01676 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01676 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01676 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01676 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01676 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms