Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cops6O88545 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops6O88545 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops6O88545 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops6O88545 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops6O88545 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops6O88545 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cops6O88545 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cops6O88545 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cops6O88545 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cops6O88545 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cops6O88545 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops6O88545 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops6O88545 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops6O88545 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms