Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra6O70491 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra6O70491 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra6O70491 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stra6O70491 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stra6O70491 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stra6O70491 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stra6O70491 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stra6O70491 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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