Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AurkbO70126 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AurkbO70126 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AurkbO70126 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AurkbO70126 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AurkbO70126 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkbO70126 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkbO70126 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AurkbO70126 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AurkbO70126 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AurkbO70126 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkbO70126 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkbO70126 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AurkbO70126 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AurkbO70126 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AurkbO70126 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AurkbO70126 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms