Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ChkbO55229 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ChkbO55229 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChkbO55229 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChkbO55229 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChkbO55229 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms