Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp26a1O55127 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26a1O55127 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms