Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nck2O55033 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nck2O55033 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nck2O55033 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nck2O55033 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nck2O55033 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nck2O55033 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nck2O55033 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nck2O55033 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nck2O55033 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nck2O55033 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nck2O55033 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nck2O55033 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nck2O55033 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nck2O55033 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nck2O55033 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nck2O55033 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms