Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Srpk2O54781 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Srpk2O54781 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms