Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FxnO35943 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FxnO35943 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FxnO35943 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FxnO35943 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FxnO35943 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FxnO35943 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FxnO35943 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FxnO35943 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FxnO35943 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FxnO35943 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FxnO35943 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FxnO35943 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FxnO35943 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FxnO35943 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FxnO35943 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FxnO35943 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FxnO35943 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FxnO35943 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FxnO35943 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FxnO35943 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FxnO35943 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FxnO35943 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FxnO35943 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FxnO35943 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FxnO35943 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FxnO35943 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FxnO35943 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FxnO35943 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FxnO35943 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FxnO35943 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FxnO35943 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FxnO35943 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FxnO35943 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FxnO35943 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FxnO35943 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FxnO35943 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FxnO35943 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FxnO35943 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FxnO35943 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FxnO35943 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FxnO35943 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FxnO35943 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FxnO35943 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FxnO35943 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FxnO35943 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FxnO35943 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FxnO35943 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FxnO35943 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FxnO35943 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FxnO35943 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FxnO35943 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FxnO35943 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FxnO35943 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FxnO35943 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FxnO35943 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FxnO35943 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FxnO35943 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FxnO35943 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FxnO35943 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FxnO35943 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FxnO35943 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FxnO35943 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FxnO35943 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FxnO35943 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FxnO35943 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FxnO35943 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FxnO35943 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FxnO35943 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FxnO35943 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FxnO35943 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FxnO35943 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FxnO35943 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FxnO35943 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FxnO35943 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FxnO35943 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms