Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek2O35942 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nek2O35942 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek2O35942 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek2O35942 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek2O35942 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nek2O35942 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek2O35942 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek2O35942 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nek2O35942 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms