Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf18O35714 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms