Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NudcO35685 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NudcO35685 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NudcO35685 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NudcO35685 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NudcO35685 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NudcO35685 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NudcO35685 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NudcO35685 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NudcO35685 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NudcO35685 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NudcO35685 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NudcO35685 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NudcO35685 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NudcO35685 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NudcO35685 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NudcO35685 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NudcO35685 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NudcO35685 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NudcO35685 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NudcO35685 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NudcO35685 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NudcO35685 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NudcO35685 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NudcO35685 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NudcO35685 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NudcO35685 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NudcO35685 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NudcO35685 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NudcO35685 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NudcO35685 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NudcO35685 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NudcO35685 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NudcO35685 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NudcO35685 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NudcO35685 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NudcO35685 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NudcO35685 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NudcO35685 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NudcO35685 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NudcO35685 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NudcO35685 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NudcO35685 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NudcO35685 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NudcO35685 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NudcO35685 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NudcO35685 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NudcO35685 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NudcO35685 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NudcO35685 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NudcO35685 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NudcO35685 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NudcO35685 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NudcO35685 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NudcO35685 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NudcO35685 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NudcO35685 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NudcO35685 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NudcO35685 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NudcO35685 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NudcO35685 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NudcO35685 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NudcO35685 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NudcO35685 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NudcO35685 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NudcO35685 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NudcO35685 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NudcO35685 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NudcO35685 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NudcO35685 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NudcO35685 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NudcO35685 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NudcO35685 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NudcO35685 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NudcO35685 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NudcO35685 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NudcO35685 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NudcO35685 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NudcO35685 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NudcO35685 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NudcO35685 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NudcO35685 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NudcO35685 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NudcO35685 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NudcO35685 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NudcO35685 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NudcO35685 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NudcO35685 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NudcO35685 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NudcO35685 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NudcO35685 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NudcO35685 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NudcO35685 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NudcO35685 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NudcO35685 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NudcO35685 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NudcO35685 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NudcO35685 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NudcO35685 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NudcO35685 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms