Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pitx3O35160 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx3O35160 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms