Protein–RNA interactions for Protein: M0QWB7

Ascl5, Achaete-scute family bHLH transcription factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl5M0QWB7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl5M0QWB7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl5M0QWB7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms