Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vwa3bJ9JI28 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms