Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2056J3QQ02 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms