Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm9602J3QPD5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9602J3QPD5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms