Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm933J3QPC1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm933J3QPC1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms