Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21863J3KMP8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21863J3KMP8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21863J3KMP8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21863J3KMP8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21863J3KMP8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms