Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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Taf4bG5E8Z2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Taf4bG5E8Z2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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